נוהל חירום הופעל בשירותים הווטרינריים במשרד החקלאות נוכח גל שפעת העופות שמתרחב בצפון הארץ כשבנוסף ל-244 אלף המטילות שהומתו במושב מרגליות בתחילת השבוע, התגלה בסוף השבוע כי יש להמית 320 אלף מטילות נוספות סמוך ליישוב. במשרד החקלאות מודאגים מהאפשרות להדבקת בני אדם מלולים נגועים הצמודים לבתי תושבים.

כתוצאה מהתפרצויות שפעת העופות, צפוי מחסור בשוק הביצים בישראל, מחסור של כ-14 מיליון ביצים בחודש. שר החקלאות הורה על פעולות למניעת התרחבות ההתפרצות מחוץ ליישוב מרגליות ועל פתיחת מכסות לייבוא ביצים כדי לענות על המחסור

בהערכת מצב שנערכה במשרד צוין כי עם קבלת הדיווח על חשד לשפעת עופות בלולים, משרד החקלאות בודד את הלולים ועצר לאלתר את שיווק הביצים •סך כל הלולים במרגליות משווקים כ-14 מיליון ביצים בחודש בשוק המקומי • נוכח מצב החירום הורה שר החקלאות להיערך לפתיחת יבוא  ביצים ללא מכס על מנת למנוע מחסור במיליוני ביצים. 
שר החקלאות, עודד פורר: “עם קבלת ההודעה על מוקד נוסף של שפעת עופות בלולי מטילות במושב מרגליות, הנחיתי את הצוות המקצועי להיערך לפתיחת יבוא ביצים ללא מכס באופן מידי, כך שתושבי ישראל ימשיכו לצרוך את הביצים ללא מחסור. כמו כן, הנחיתי את השירותים הווטרינריים לנקוט בכל אמצעי שבידם כדי שהאירוע לא יגלוש ממרגליות ליישובים סמוכים.
שפעת עופות מזן H5N1 התגלתה צמוד למושב מרגליות הסמוך לגבול לבנון. במקבץ הלולים 320 אלף תרנגולות מטילות. השירותים הווטרינריים במשרד החקלאות ופיתוח הכפר בודדו את הלולים, עצרו את שיווק הביצים לאלתר, הן מהלול והן מתחנת המיון שקלטה ביצים מהמתחם, והחלו בפעולות הכנה לטיפול במוקד ההתפרצות. השירותים הווטרינרים מבצעים ניטור אקטיבי בכל חוות הלולים שבאזור. 
לולים אלו והלולים שהתגלתה בהן המחלה בתחילת השבוע משווקים כ-14 מיליון ביצים בחודש בשוק המקומי (מתוך שוק של כ-200 מיליון ביצים שנצרכות בחודש בישראל). לולים אלו מצטרפים ללולי המטילות שנמצאו נגועים בשפעת עופות בתחילת השבוע. על מנת למנוע מחסור בשוק, משרד החקלאות נערך לפתיחת יבוא של 70 – 100 מיליון ביצים ללא מכס כבר בתחילת השבוע.
מאז המקרה של שפעת עופות בסוף השבוע באגמון החולה בעגורים, מבצעים השירותים הווטרינריים במשרד החקלאות ניטור אקטיבי של כלל לולי הצפון. החשד הראשוני לתחלואה עלה בעקבות תמותה מוגברת של תרנגולות במקום. דגימות  נלקחו למעבדה, שם התקבל האישור לאבחון. בעקבות זאת, השירותים הווטרינריים כאמור נקטו בצעדים מתחייבים על מנת לעצור את שרשרת ההדבקה. 
בכל אירועי שפעת העופות השנה, כמו גם בזה הנוכחי, היה מעורב נגיף מזן H5N1 שעלול לגרום בסיכון נמוך לתחלואה בבני אדם. משרד החקלאות שב ומזכיר לציבור להקפיד על צריכת מוצרי עוף וביצים רק לאחר בישול, כיוון שטיפול בחום גבוה (בישול, אפייה, טיגון) משמיד את כלל החיידקים והנגיפים בעופות. במשרד מציינים כי המלצה זו תקפה בשגרה, וכעת ביתר שאת. 
מקרה זה מצטרף, למקרים נוספים מהתקופה האחרונה, בהם זוהתה שפעת עופות מזן H5N1, ב-60 לולים במושב מרגליות, באגמון החולה, בכפר ברוך, קיבוץ עין צורים, אביגדור, מעיין צבי ונהלל ובעופות בר נוספים. בכל המקרים, הטיפול של משרד החקלאות הסתיים זה מכבר. 
כידוע, בעונה זו של השנה, מאות אלפי עופות עוברים בישראל בדרכם לאפריקה. נוכחותם של עופות בתקופת נדידה מגבירה את הסכנה להעברת מחלות שונות, ובראשן – שפעת העופות. לאור זאת, שב ומזהיר משרד החקלאות כי על כל מגדלי העופות והציפורים, למלא אחר הנחיות השירותים הווטרינריים, ולמנוע שוטטות של עופות בשטחים פתוחים. על כל  מקרי תחלואה ותמותה חריגים בעופות יש לדווח מיד לווטרינר המטפל, לווטרינר הרשותי ולשירותים הווטרינרים במשרד החקלאות. בכל מקרה אין להשליך פגרי עופות בצורה לא מוסדרת. 
מאז מרץ 2006, אז התגלו מקרי שפעת עופות בקיבוץ חולית ועין השלושה שבדרום הארץ ובמושב שדה משה שבחבל לכיש, מתגלים מקרי שפעת כמעט בכל שנה.